Museum Candi Prambanan merupakan museum khusus yang terletak di Kompleks Candi Prambanan Daerah Istimewa Yogyakarta. Museum ini terletak di sisi utara Candi Prambanan. Bangunan museum berbentuk rumah tradisional Jawa berupa Rumah Joglo. Terdapat tiga bangunan utama pada museum ini. Bangunan pertama berisi sejarah dan artefak dari Kompleks Candi Prambanan dan bangunan candi lain di sekitarnya. Bangunan kedua berisi mengenai info bagaimana candi dibangun yang ditampilkan dalam bentuk infografis dan video animasi mengenai pembangunan Candi Prambanan, dan bangunan ketiga berisi sejumlah artefak kepala Buddha dari Candi Borobudur.
Museum berada di bawah kepemilikan Kementerian Pendidikan dan Kebudayaan serta dikelola oleh Balai Pelestarian Cagar Budaya DI Yogyakarta. Hampir semua koleksi museum merupakan benda peninggalan Kerajaan Mataram Kuna. Museum ini menyajikan koleksi batuan dan berbagai arca yang ditemukan di sekitar Candi Prambanan, seperti arca Nandi, arca Durga, arca Ganesha, arca Siwa, dan lain-lain. Selain itu juga terdapat replika cagar budaya yang ditemukan di Wonoboyo yang berupa mangkuk dengan desain relief Ramayana, tas, dan perhiasan emas.